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2005-01-24 19:29:29 | Hit : 26003 | Vote : 7764

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CpG-island

CpG-island

Human Genome를 보면 다수의 CG dinucleotide가 보인다. 이것을 CG pair와 구분하기 위해 CpG라고 부른다. C (Cytosine)는 일반적으로 methylation되어 있다.
methyl-C는 T로 변환될 확률이 높기 때문에, CpG는 Genome에서 C와 G의 독립발생 빈도보다, 보기 드물어야 한다. 그러나, promoter주변이나, 많은 gene들의 start region에서는 methylation process가 supppress되어야 하기 때문에 많은 CpG들을 발견할 수 있다. 이들 region을 CpgIsland라고 하며, 전형적으로 몇백에서 몇천 base길이를 이룬다.

CpG island는 gene의 상부 2/3부분에 위치하는 5'-CG-3'가 풍부한 1-2kb의 긴 DNA sequence(C및의 P는 C가 5'P에 위치한다는 뜻)로 methylation이 되지 않는 포유동물의 housekeeping transcription regulatory region(promotor, regulatory DNA 등)이 포함된 부분이다. CpG island chromatin은 hyperacetylated histone이 풍부하고 linker histone이 부족하다.
많은 경우 세포는 differentiate되기 전에 1번 이상의 DNA 복제를 거치게 된다. 왜냐면 분화를 시작하기 전에 DNA methylation pattern을 수정하는것이 필요하기 때문이다.
DNA methylation은 eukaryote에서 cyrosine ring에 C5에 methyl group을 부가하는 것이다.
DNA methylation은 DNA replication할 때 일어난다.
mouse에서 X-chromosome과 genomic imprinting을 inactivation하는데 중요한 역할을 하며 tissue-specific gene expression에도 중요하다.
CpG island가 methylation되면 transcription이 안되어 silent해진다.
많은 cancer환자의 tumor suppressor gene, DNA repair gene, genes for hormone receptors, angiogenesis를 억제하는 gene등 cancer-related gene이 hypermethylated된 것으로 나타났다.

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